El horario del Museo es de lunes a domingo y su apertura varía según la temporada: normalmente, inicia desde las 10:00 a.m. hasta las 6:00 p.m., y, en vacaciones es de 9:00 a.m. a 6:00 p.m. Cabe resaltar que el horario es continuo y, por lo tanto, no cierra al medio día. Por otra parte, los días festivos solo se abre taquilla.

En el parqueadero público más cercano al Museo Naval: Tequendama Parking Cartagena, ubicado detrás del Parque de La Marina.

Se ingresa por la entrada principal, ubicada frente a la Plaza Santa Teresa. 

Está permitido el ingreso de mascotas siempre y cuando se trate de animales domésticos. 

El Museo Naval no cuenta con guardarropa, el visitante podrá traer su propio morral.